Olbrzymia Rosja jest w dużym stopniu uzależniona od transportu kolejowego, a Moskwa jest największym w kraju węzłem kolejowym. Przez dziewięć moskiewskich dworców przewija się codziennie ponad dwa miliony pasażerów. Linie kolejowe promieniście rozchodzące się z Moskwy łączą ją z pozostałymi częściami byłego ZSRR. Najbardziej obciążone są linie prowadzące do Petersburga, Kijowa i obecnie elektryfikowana kolej Transsyberyjska wiodąca do położonego na wschodnich rubieżach Rosji Władywosocku
Moskwa jest też wielkim węzłem żeglugi śródlądowej. Wprawdzie po rzece Moskwie mogą pływać tylko stosunkowo niewielki jednostki, jednak po leżącym w pobliżu kanale łączącym Moskwę z Wołgą mogą już żeglować nawet największe statki oceaniczne. W mieście funkcjonują trzy wielkie porty towarowe i trzy pasażerskie obsługujące głównie połączenia lokalne.
Moskwa jest jednym z największych na świecie węzłów komunikacji lotniczej. Połączenia z odległymi regionami kraju i zagranicą zapewniają miastu cztery lotniska. Największe z nich, międzynarodowy port lotniczy Szeremietiewo 2, zostało wybudowane w 1979 roku, około 30 km na północny zachód od centrum miasta. Przez lotnisko przewijają się około 15 tysięcy pasażerów dziennie. Szeremitiewo 1, Wnukowow, Bykowo i Domediedowo obsługują głównie połączenia krajowe.
Transport w obrębie miasta zapewnia rozbudowany i wydajny system komunikacji zbiorowej. Po Moskwie można się przemieszczać autobusami, tramwajami albo trolejbusami. Najszybciej jest jednak podróżować metrem. Moskiewskie metro, otwarte w 1935 roku, jest prawdziwym arcydziełem architektury. W sumie wszystkie linie metra maja około 200 kilometrów długości i 141 stacji. Stacje metra w centrum miasta są bogato zdobione; szczególnego uroku dodają im ciężkie żyrandole, witraże w stylu art. Deco i liczne posągi. Z moskiewskiego metra korzysta każdego dnia około 8 milionów ludzi.
Moskwa jest zarówno stolicą państwa, jak i obwodu moskiewskiego. Siedzibą rządu centralnego jest Kreml, gmachy niektórych ministerstw znajdują się jednak poza jego numerami. Ministerstwo Spraw Zagranicznych mieści się w stalinowskim wieżowcu na obrzeżach śródmieścia. Kilka innych urzędów centralnych znajduje się w wysokościach przy Prospekcie Kalinina. Aż do końca lat osiemdziesiątych stolicą faktycznie rządzili urzędnicy z miejskiego komitetu partyjnego. Dopiero po upadku komunizmu, w 1991 roku, mieszkańcy wybrali w wolnych wyborach mera. W tym samym czasie w Moskwie przeprowadzono reformę administracyjną. Obecnie miasto podzielone jest na 10 okręgów. Każdym z okręgów zarządza wyznaczony przez mera perfekt. Okręgi dzielą się na rejony , w sumie jest ich w Moskwie 134.